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更新時(shí)間：2024-06-18簡(jiǎn)要描述：德國 DECODON Delta2D蛋白質(zhì)雙向電泳凝膠分析軟件
德國 DECODON 公司之 Delta2D 分析軟件在雙向凝膠（2D 及DIGE）分析中*應用點(diǎn)對點(diǎn)圖像變形技術(shù)（warping） ，通過(guò)簡(jiǎn)單步驟，使用TIGR Multiple Experiment Viewer 數學(xué)程式 （MeV, version 4.0, tm4.org/mev.html, Saeed et al. 2003） 并配合全新*智能向量技術(shù) （SmartVectors™ Technology）更快， 更有效， 更準確進(jìn)行2D凝膠圖像處理
1. 有效消除不同2D凝膠間于跑膠時(shí)所產(chǎn)生的微少區別, 免去一系列冗長(cháng)枯燥的斑點(diǎn)匹配和邊界確定的編輯工作，并可視化比較斑點(diǎn)， 達致* 斑點(diǎn)匹配 （* Spot Matching）。
2. 配合融合圖像技術(shù)（Image Fusion），把多個(gè)圖像透過(guò)點(diǎn)對點(diǎn)變形合并到一個(gè)新的圖像中。從而創(chuàng )建一個(gè)擁有所有能收集到的斑點(diǎn)的蛋白組圖譜（proteome map） 或 把多個(gè)平行實(shí)驗精簡(jiǎn)到單個(gè)平均圖像來(lái)進(jìn)行分析。
3. 實(shí)時(shí)網(wǎng)上偵察和量化分析 （GenBank ， GenoList 及其它），你能更快更簡(jiǎn)單分析眾多的2-D膠和DIGE膠， 并能取得更多信息。4. 能完整及準確表達2-D 及DIGE 電泳圖像， 并能進(jìn)行管理和注釋斑點(diǎn)信息， 報告和導出結果。5. 2010年發(fā)表的相關(guān)文章：Delta2D 和 Proteomweaver：兩款2-DE分析工具的性能評估主要內容如下：Delta2D 和 Proteomweaver：兩款2-DE分析工具的性能評估 Delta2D and Proteomweaver: Performance evaluation of two differentapproaches for 2-DE analysis Electrophoresis 2010, 31, 1311–1317Renato Millioni1、Manuela Miuzzo2、Stefano Sbrignadello、Ellen Murphy11,3、Lucia Puricelli1、Andrea Tura3、Elisa Bertacco1、Marcello Rattazzi1、Elisabetta Iori1、Paolo Tessari1 電泳學(xué)雜志《Electrophoresis》于2010年31卷發(fā)表了一篇Decodon公司的2-DE（2D凝膠電泳）分析軟件Delta2D （D2D）與另一款同類(lèi)分析軟件Proteomweaver （PW）性能比較的文章，題目是：《Delta2D 和 Proteomweaver：兩款2-DE分析工具的性能評估》。主要內容如下： 2-DE是研究蛋白質(zhì)組的重要手段。然而，盡管2-DE技術(shù)能夠同時(shí)高效分離多個(gè)蛋白質(zhì)，但該技術(shù)的不足之處在于重復性差，特別是在比較不同實(shí)驗室的實(shí)驗數據時(shí)尤為明顯。2-DE電泳產(chǎn)生差異的原因主要可分為兩類(lèi)：實(shí)驗過(guò)程中造成的和實(shí)驗后造成的。實(shí)驗過(guò)程中差異的出現主要是由物理和化學(xué)參數決定的；而實(shí)驗后造成差異的主要原因是使用不同的分析軟件，特別是工作程序的不同。用于分析2-DE的軟件很多，對凝膠圖像的識別與處理方式各不相同；目前為止尚未有相關(guān)研究說(shuō)明這些分析軟件在2-DE分析過(guò)程中的優(yōu)劣。在Electrophoresis 的這篇文章里面，意大利Padua大學(xué)的Renato Millioni等人利用Delta2D和 Proteomweaver兩套軟件對相同的凝膠圖像（標準凝膠、實(shí)驗凝膠圖像）進(jìn)行分析比較，結果顯示：對于標準凝膠圖像，比起PW來(lái)，D2D的錯漏數低50%、假陽(yáng)性數低77%、陽(yáng)性正確率高19%，并且斑點(diǎn)匹配率高4%；在實(shí)驗凝膠圖像的比較中發(fā)現D2D要比PW節省30%的時(shí)間，并且人為參與的部分更少。 軟件：Proteomweaver version 3.0（Bio-Rad, CA, USA） ，Delta2D version 4.0 （Decodon, Greifswald, Germany） 凝膠圖像：實(shí)驗凝膠圖像：來(lái)自Padua大學(xué)的Renato Millioni實(shí)驗室實(shí)驗凝膠圖像，共兩組（組A，組B，如圖1）圖像變形：通過(guò)對軟件相關(guān)參數的設置模擬凝膠在實(shí)驗過(guò)程中因各種物理化學(xué)參數產(chǎn)生的凝膠變形。
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